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最后一块拼图,人类Y染色体的完整序列首次公布
几十年来,由于结构上的复杂性,Y染色体一直是基因组学界面临的众所周知的挑战。现在,这个棘手的基因组区域终于被完全测序。端粒到端粒(T2T)联盟的研究人员于本周在《Nature》杂志上发表了这项成果。这个联盟由加州大学圣克鲁斯分校生物分子工程学助理教授Karen Miga共同领导。目前,带有注释的完整Y染色体参考序列已发布在USUC Genome Browser上,也可通过Github访问。[查看]
http://www.cxbio.com/Article/zhykptrlyrstdwzxlscg_1.html
Nat Genet:新方法揭示基因“增强子”的工作机理
来自日本理化研究所(RIKEN)综合医学科学中心和肿瘤分子研究所(IFOM)的研究人员与京都大学、卡罗林斯卡研究所和DNAFORM的合作者一起开发出了一种被称为NET-CAGE的新技术,揭示了基因组中被称为增强子的非编码基因的结构,增强子可以激活特定基因的功能。基因组的这些部分曾经被认为是不重要的,被称为"垃圾DNA",现在已知与各种疾病有关,了解它们的功能已经成为基因组学研究的一个重要目标.[查看]
http://www.cxbio.com/Article/natgenetxffjsjyzqzdg_1.html
外泌体的应用——有机遇,也有挑战
外泌体(exosome)是细胞分泌囊泡(extracellular vesicles)的一种亚型,存在于生物体液中,并参与多种生理和病理过程。外泌体被认为是细胞间通信的一种新机制,允许细胞交换蛋白质、脂质和遗传物质。过去,细胞分泌的外泌体一度被认为只是参与废物排泄;现在,随着高通量蛋白质组学和基因组学的发展,外泌体被广泛认为是生物体内细胞间短距离和长距离交流的高度保守的途径,这种细胞间通信对于正常细胞和肿瘤细胞都是非常重要的。[查看]
http://www.cxbio.com/Article/wmtdyyyjyyytz_1.html
Sci Rep:鉴定出T细胞的炎性生物标志物
在一项新的研究中,来自美国马歇尔大学药学院和马歇尔大学琼-爱德华兹医学基因组学核心学院的研究人员探究了人T细胞在炎症条件下的功能。相关研究结果于2018年7月19日发表在Scientific Reports期刊上[查看]
http://www.cxbio.com/Article/scirepjdctxbdyxswbzw_1.html
Genome Res:科学家开发出能对单细胞进行大规模分析的新型工具—BigSCale
近日,一项刊登在国际杂志Genome Research上的研究报告中,来自西班牙的研究人员通过研究提出了一种复杂的计算机框架来分析单细胞的基因表达水平,这一技术可以扩展到对数百万个独立的细胞进行分析处理,这项研究中,研究人员首次开发了一种工具来分析诸如大规模的单细胞RNA序列数据库,这或能极大地扩展单细胞基因组学的研究范围。[查看]
http://www.cxbio.com/Article/genomereskxjkfcnddxb_1.html
Cell Rep:科学家发现一种新型的机体免疫系统调节因子
研究者Riitta Lahesmaa教授说道,我们发现,名为HIC1(Hypermethylated In Cancer 1)的蛋白质或许充当了调节性T细胞的关键调节子,能够帮助控制促进T细胞功能发挥的大量基因进行表达;此外,研究人员还利用全基因组学的技术进行研究发现,HIC1能够结合到细胞核的特殊位点上,而这些位点中经常含有和免疫介导性疾病相关的遗传突变。[查看]
http://www.cxbio.com/Article/cellrepkxjfxyzxxdjtm_1.html
Science子刊:利用RNAi盒培育出不含黄曲霉素的转基因玉米
如今,在培育不含黄曲霉素的玉米的过程中,来自美国亚利桑那大学和亚利桑那州基因组学研究所的研究人员开发出一种靶向真菌基因aflC 上的三个区域的RNA干扰盒。当被转染进玉米中时,这种RNAi盒降低被黄曲霉菌感染的玉米粒中的基因aflC表达,从而降低真菌黄曲霉素产生。[查看]
http://www.cxbio.com/Article/sciencezklyrnaihpycb_1.html
基因+人工智能,Deep Genomics将会把精准医疗带往何处?
Deep Genomics就是人工智能和基因组学联姻的产物,即“Deep Learning + Genomics”。在用深度学习研究基因组学的时代,Deep Genomics推开了第一扇窗。[查看]
http://www.cxbio.com/Article/jyrgzndeepgenomicsjh_1.html
单分子实时测序于海洋生物<font color='red'>基因组学</font>研究应用
自从末端终止法测序技术发明以来,DNA测序技术在短短三十余年内得到迅速发展,科学家们已经向着人类千元(1000 美元)基因组时代发起冲击。最初由于高昂测序成本的限制,全基因组测序涉及的领域受到限制,只有细菌等基因组很小的生物的全基因组被首先测定,线虫、果蝇、拟南芥等模式生物的基因组随后被测定,人类基因组计划的实施推动了基因组学在全世界的快速发展。这些测序工作都是采用Sanger法进行,项目实施耗时费力。随着新一代测序技术(Next-generation sequencing, NGS)的出现,越来越多[查看]
http://www.cxbio.com/Article/dfzsscxyhyswjyzxyjyy_1.html
供应Sciencell原代细胞
原代细胞不仅广泛应用于分子、细胞生物学和生物医学基础研究,如蛋白质组学、基因组学、细胞株(系)研究、DNA,RNA和遗传学研究等,还可应用于当今热门的生物医药产业如药物筛选、药物代谢和毒理研究、癌症药物的研究等。原代细胞在生物医药领域有不可替代性作用,市场前景广阔。 除了部分终末分化的细胞,一般的细胞都能传代6-8代及以上,有些细胞甚至更多,但是一般都建议客户采用3-4代以内的细胞。在原代细胞培养过程中,一般是初次培养过夜后换液,以后每隔2-3天换一次液,以培养液的颜色为标准,一般变黄后就需换液。原代细胞的传代前[查看]
http://www.cxbio.com/Article/1317_1.html
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